Vilniaus medicinos draugija buvo įkurta 1805 metais gruodžio 12 d. – pirmoji medicinos draugija Rytų Europoje. Draugija įkurta profesoriaus J. Franko iniciatyva, Vilniaus universiteto klestėjimo laikais.

Vilniaus medicinos draugija susikūrė kaip gydytojų ir farmacininkų tobulinimosi forma, kaip patirties ir mokslinės informacijos keitimosi organizacija.

Ji rūpinosi ne tik profesiniais reikalais, mokslo naujovių diegimu, bet ir šalies sanitariniais, socialiniais reikalais, gydytojų ir kultūros darbuotojų vertės suvokimu ir iškėlimu.

Draugijos devizą „Tarnauti mokslui ir gimtajam kraštui“ patvirtina daugybė jos veiklos faktų. Per Draugiją Vilniaus gydytojus pasiekdavo Europos ir pasaulio medicinos naujovės labai greitai.

Savo veiklą Vilniaus medicinos draugija tęsia jau du šimtmečius. Šiuo metu draugija vienija visų Vilniaus medicinos specialybių mokslines draugijas ir reguliariai rengia posėdžius, teikia premijas, dalyvauja Medicinos fakulteto veikloje, turi nuopelnų Vilniaus medicinai ir visai šaliai, tebėra kaip istorinė kultūros institucija.